基因测序新方法为研究HPV相关肿瘤的起源开辟新路径

宫颈癌每年夺走超过31.1万人的生命，而其中的关键原因是人乳头瘤病毒（HPV）在其基因组上的整合。

近期，华中科技大学同济医学院黄晓园教授团队在国际知名期刊《BMC Genomics》上发表了题为“Long-read sequencing reveals the structural complexity of genomic integration of HPV DNA in cervical cancer cell lines”的重要研究成果，他们通过对所获得的序列数据进行深度剖析，揭示了HPV整合现象的高度复杂性。

研究团队通过运用长测序技术，不仅精确识别出HPV整合的断裂点，而且证实其在准确性方面可媲美常规的高通量测序（NGS）方法。此项研究更进一步构建了详尽的复杂整合基因组结构模型，其中包含了HPV基因组及临近人类基因组区域的详细信息。

研究者们还在HPV整合断点周围的人类基因组和HPV基因组序列中发现了微同源性片段，这提示了微同源重组可能参与了HPV整合过程。

黄晓园教授团队凭借PacBio长测序技术成功建立了SiHa和HeLa细胞中HPV整合基因组的精细结构模型，揭示HPV病毒如何复杂而深刻地影响宫颈癌，并提出SiHa细胞中染色体13上的结构变异可能与基因表达调控的关系。这些重大发现深化了大家对HPV16和HPV18整合过程，为发现宫颈癌发展的分子机制以及潜在治疗靶点奠定了坚实的基础。研究强有力地证明了长测序技术在探测和解析HPV基因组整合结构上的巨大潜力和价值，为研究HPV相关肿瘤的起源开辟了新路径。
 
 

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